En 1995 la AEMP recibe una invitación al Congreso Científico Internacional organizado por la Federación Latinoamericana de Sociedades Científicas de Estudiantes de Medicina FELSOCEM a realizarse en Argentina. En ese momento no existía una sociedad científica como tal, por lo que el editor en jefe de la Revista Médico Científica (Jorge Calzada) acepta la invitación y viaja al congreso para establecer los primeros contactos con la FELSOCEM.

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A su regreso, queda clara la necesidad de crear una sociedad científica y le confía esta laboriosa tarea a Nelson Ferrer.​ Inicialmente, fue llamado Grupo de Investigación de la Facultad de Medicina de la Universidad de Panamá, para posteriormente cambiarlo al nombre que lleva en la actualidad.

En 1996 en Cuzco, Perú el  CCAEMP participa por primera vez de manera formal en el Congreso Científico Internacional.